Bioskryb PTA技术-单细胞全基因组扩增技术

单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项技术,其原理是对分离的单个细胞微量全基因组DNA进行扩增,获得较高覆盖率,较完整的基因组后进行高通量测序,广泛应用于癌症研究、胚胎发育、辅助生殖、细胞分化、免疫机制、微生物等方向的研究。BioSkryb 的 ResolveDNA™平台可以提供单细胞全基因组扩增。

产品详情

 

BioSkryb 的 ResolveDNA采用PTA (Primary Template-directed Amplification)原代模板定向扩增技术,采用抗核酸外切酶活性的终结子 (化学修饰的核苷酸) 实现拟线性扩增 (quasi-linear process),绝大多数扩增子来源于原始模板的扩增,扩增产物无法再次被复制,因此扩增过程产生的错误不会被放大,并且Phi29 DNA 聚合酶可减少扩增错误率,此外,还可以扩增线粒体基因组 (Mitochondrial Genome)。

 

 

PTA技术亮点

1PTA技术具有较好的覆盖度

 

由下图可见,PTA的基因组覆盖度最接近Bulk测序的水平,其覆盖度达到95%以上

2)PTA技术具有较好的分辨率和均一性

 

3)PTA技术具有较好的保真性

4)PTA技术具有较好的收率和重现性

 

为了验证PTA技术具有较好的收率和重现性,该实验中加了质控DNA(1ng到10pg)、单个细胞起始量、5个细胞起始量。

可以看到在单细胞层面,经PTA扩增后,单细胞基因组从6pg起始能达到1.5-2ug的水平,可满足后续的建库流程及PCR-Free的流程。

5)PTA技术同时获取线粒体基因组数据

 

如下图所示,使用PTA技术对单细胞基因组进行扩增,除了获得基因组上的数据之外,同时获得了线粒体基因组上的结果。

PTA技术的应用领域

 

*本产品仅限科研使用,不可用于临床诊断流程