350nm精准"抓蛋白"!Syncell黑科技让空间蛋白质组再上新高度!

空间蛋白质组学这个概念,想必大家都非常熟悉,近几年深受科学家的偏爱,每年都有数百篇空间蛋白质组学相关的文章发表,尤其是《Nature Methods》将空间蛋白质组学技术评为了2024年年度技术,使得这一技术更是备受瞩目!


虽然现有的空间蛋白质组学技术已经帮助研究人员拿到了很多好的结果,但是目前的空间蛋白质组学技术,依然存在一些痛点,例如:

① 抗体依赖性强:传统方法受限于抗体质量和数量          
② 低丰度蛋白难捕获:关键信号蛋白易被遗漏          
③ 亚细胞分辨率不足:难以精确定位细胞器级蛋白分布

今天我们为您介绍的Syncell公司的这款新的空间蛋白质组学技术,将完美的解决以上痛点,实现单细胞/亚细胞分辨率的空间蛋白质组无偏检测,可以不依赖抗体,实现目标区域所有蛋白质的检测,并且可以实现低丰度蛋白的检测,发现一些新的疾病标志物或者用药靶点!

Microscoop Mint——空间蛋白质组学光标记捕获系统

Microscoop®Mint是一款突破性的空间蛋白质组学平台,已被用于揭示许多生物学问题中感兴趣的特定细胞/亚细胞区域内新的蛋白质组成。Microscoop®Mint执行显微“挖掘”操作,即通过自动化的双光子激光引导的光生物素化标记,以对自动圈选的目标区域内足够多的细胞/亚细胞蛋白质进行光标记和分离/采集,然后通过质谱检测实现空间蛋白质组学新的发现。这是一种前所未有的空间捕获技术,能够在高分辨率、高灵敏度和高特异性下实现无偏的细胞/亚细胞蛋白质组鉴定,并能够从目标区域中准确发现新的蛋白质成分。

 

Microscoop Mint——空间蛋白质捕获原理

空间蛋白质光标记是通过双光子激光扫射触发光催化剂的光化学反应实现,该反应驱动由生物素和光可激活的氨基酸连接臂组成的分子发生氧化还原反应,与被扫射焦点区域内的氨基酸形成共价键从而对其进行生物素化,达到亚微米级标记分辨率。每个扫射点的持续时间为毫秒或亚毫秒级,从而实现对整个组织切片中的目标区域的快速生物素化。


Microscoop Mint——工作流程

1,样本制备:

首先,对样本切片进行多色免疫荧光染色,成像,定位自己感兴趣的区域(ROI)。

其次,将染色后的样本与光标记试剂孵育(即 Synlight-RichTM 试剂盒),为后续进行光生物素化标记目标蛋白做准备。

2,实时ROI计算与光标记:

将孵育好的切片放置到载物台上,在一个视野下圈选自己的感兴趣的ROI区域,并对圈选的ROI区域进行双光子激光扫射,在ROI区域内的可光活化的生物素在激光的照射下,与蛋白质以共价键的方式结合,从而实现目标区域蛋白质的光生物素化标记。

3,多轮自动光标记:

当完成第一个视野的光生物素标记后,系统会自动进行下一个视野的ROI圈选和光标记。就这样进行逐个视野的自动化靶向光标记,一张片子根据需求,大概要扫描上万个视野。

4,蛋白质富集&酶解

将组织切片从玻片上刮下来收集到一起,刮取后的样品随后使用Syncell蛋白提取试剂盒(即 SynpullTM 试剂盒)处理,以裂解样品,然后通过链霉亲和素磁珠与生物素标记的蛋白质结合,从而实现目标区域蛋白质提取,并将其消化为肽段用于蛋白质组分析。

 5,LC/MS-MS & 数据分析 

收集的肽段被送入质谱仪进行 LC-MS/MS 分析(适配Thermo/Bruker/Sciex主流质谱仪),从而获得光标记和对照组(邻片,未被激光扫射)样品的蛋白质组。通过比较对照组和光标记组的蛋白质,可高灵敏度、高特异性、高空间精度地获得目标区域的特异性蛋白质组。后续可通过免疫染色共定位或附加功能实验进行蛋白质的验证。

 

Microscoop Mint——技术优势



Microscoop Mint——空间蛋白质捕获数据展示

Microscoop Mint可以对细胞/亚细胞分辨率的区域进行精准的空间捕获。下图展示的是通过本技术进行核孔复合体,细胞核,核仁以及应激颗粒的标记捕获。每组图片最右边展示的是通过荧光定位感兴趣的区域,中间图片展示的是实际光标记的区域,最右边图片展示的是前2张图片Merged的图片,发现二者共定位情况很好,说明光标记的精确性。

Microscoop Mint——应用领域

Microscoop Mint 像GPS导航一样精准锁定细胞内的目标区域,一次性抓出所有蛋白质成员——无需抗体、不怕微量、拒绝误伤!目前广泛应用于生物学研究的各个领域,其目的主要是通过对目标区域蛋白质组的无偏检测,发现新的蛋白质组分,从而为新的诊断标志物及药物靶点的开发奠定基础。例如:

神经科学:绘制阿尔茨海默症淀粉样斑块"蛋白质指纹",寻找新的治疗靶点       

癌症研究:解析PD-1/PD-L1免疫检查点相互作用界面,寻找新的治疗靶点        

细胞生物学:发现脂滴-线粒体新型连接蛋白,用于脂肪肝治疗靶点发现

单细胞研究:精准比较海马体vs皮质星形胶质细胞差异蛋白,解析功能机制


关于SYNCELL

Syncell 是一家创新型生命科学技术公司,致力于开发新一代蛋白质组学工具。我们首创的 Microscoop® 技术能够发现空间蛋白质组成,首次实现了无偏的亚细胞空间蛋白质组学分析。这项突破性技术可广泛应用于各种生物学问题,有助于理解分子机制、识别新的疾病生物标志物以及发现新的药物靶点。公司自成立以来,由于其突破性的技术,备受关注,并且获得了很多荣誉和奖项。 

关于仁科生物

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