SomaScan新一代高通量蛋白质组学研究平台,实现7000种蛋白质检测

SomaLogic公司推出的SomaScan Assay是一个推动开创性发现的蛋白质组学平台。SomaScan检测专注于在蛋白质组学层面上对人及其他模式动物中的血液、尿液等各类体液样本以及组织、细胞样本中的蛋白质的检测和测量。以提高对健康和疾病生物学的理解、药物靶点的识别和生物标志物的开发。SomaScan Assay可以测量7000种蛋白质,实现高通量蛋白质组学的检测和强大的数据分析。
 

SomaScan Assay技术原理

 

SomaScan Assay进行蛋白质检测的技术原理与基于抗体和质谱的方式有很大的不同。SomaScan的核心原理在于化学合成的SOMAmer试剂,该试剂的本质是DNA适配体(Aptamer,一种随机合成的单链DNA),DNA适配体都是有一定的空间构象,SomaLogic公司通过SELEX技术从1015的Aptamer库中针对每一个蛋白,进行特异的Aptamer筛选。筛选出的Aptamer可以特异性的识别目标蛋白上的单一表位,并且后续SomaLogic会对筛选出的Aptamer进行一系列的验证,确认其靶向捕获的蛋白就是目标蛋白。因此SOMAmer试剂具有很高的特异性。总的来说,SomaScan Assay技术原理就是通过SOMAmer试剂靶向捕获目标蛋白,并且SOMAmer试剂带有荧光基团,然后在芯片上通过检测荧光信号来对蛋白质进行相对定量。以下是SomaScan进行蛋白质捕获的流程示意图:

SomaScan Assay技术原理视频

 
 

SomaScan Assay技术特点

 

 

SomaScan将是您进行高通量蛋白质组学研究的首选平台。目前,该平台可以实现7000种蛋白质的检测。此外,研究蛋白的用户,都很关心蛋白质检测的变异系数,SomaScan的CV值低至5%,大大克服了基于抗体和质谱分析的固有变异性,提高数据效力,提升检测罕见表型和细微蛋白质变化的能力。在复杂的蛋白质组学体系研究中,尽可能降低了对样本量的要求;同时在细胞发育等时序分析研究中,稳定的平台尽可能避免了检出时蛋白质的“忽隐忽现”的现象,提高研究的确定性和研究的质量。SomaScan检测蛋白的动态范围可以从fM到μM,跨越10个数量级。SomaScan 参与了很多大型生物样本库和人群队列的研究,随着时间的推移积累了大量的样本经验和发表文章。

 

 

SomaScan Assay技术

在主要疾病领域的应用

 
 

 慢病领域 

心血管疾病

循环蛋白是心血管疾病的重要指标。SomaScan获得的数据在超过55篇心血管疾病相关文献中得到了应用。

糖尿病

使用SomaScan获得的数据建立的模型已被用于预测从糖尿病前期到糖尿病的进展。

肿瘤学和免疫疗法

通过检测循环蛋白,识别和表征癌症并预测对免疫疗法的反应。

神经系统疾病

SomaScan能够同时对7000种蛋白质进行分析,非常适合在少量血液或脑脊液中检测低丰度和高丰度的蛋白质。

 

 感染领域 

非酒精性脂肪肝

SomaScan可用于检测非酒精性脂肪肝病相关的生物标志物。

传染疾病

SomaScan在传染性疾病如新冠、流感、脓毒血症、TB等各个感染疾病的机制研究和生物标志物、靶标发现中均有大量发现

 

 罕见病 

SomaScan已被用于生物标志物发现和信号通路分析,以帮助诊断和开发罕见病的有效治疗方法。

 

 自体免疫疾病 

SomaScan已经在自体免疫疾病领域的研究中有很多发现,即使在系统性红斑狼疮这一类难度极大的研究中,也能找出很好的解决方案。

 
 

SomaScan Assay技术

在群体研究方向的应用

SomaLogic参与了大量的队列研究,如冰岛人群研究、芬兰人群研究、中国慢病前瞻性队列研究,以及一些专病队列研究如欧洲癌症和营养前瞻性研究,美国动脉硬化研究,等等。

在这一类研究中,其采用了GWAS共定位分析、多组学研究等手段,对于人群的分布、人群中发病的过程以及预测模型、各组学互作网络做出大量的分析,建立了各种模型,为医疗决策作出重要参考

 
 

SomaScan Assay技术

在临床研究(转化医学)方向的应用

标志物发现、新型药物靶标

临床转化医学的标志物发现和新型药物靶标的发现是蛋白质组学应用的重要方向,自从2012年SomaLogic和Novartis展开合作以来,采用SomaScan平台已经检测超过200000临床研究的样本,这些积累为标志物发现、新型药物靶标作出贡献。

病人分层帮助临床研究的决策

通过对过往队列的回顾性研究,SomaScan与全球的大药厂合作,建立类似ASCVD的模型,通过这样的模型,可以有效的对临床待入组病人进行分层,帮助进行临床决策,科学推进临床研究的进度。

药物作用机制(MOA)

通过对于干预前后的蛋白质组的观察,可以有效阐释药物的作用机制

 
 

SomaScan Assay技术更多应用方向 

 

关于SomaLogic

SomaLogic是蛋白质组学技术领域的佼佼者,致力于促进药物研发和生物标志物的发现和确定。仅需要55微升的血浆或血清样本,SomaLogic目前就可以进行7000种蛋白质测量,覆盖人体(约2万种蛋白质)的三分之一以上,是其他蛋白质组学平台的两倍。20多年来,一直为制药公司、学术机构以及合作研究组织提供支持,依靠SomaScan的蛋白质检测和分析技术来推动肿瘤、糖尿病、心血管、肝脏和代谢疾病等领域的药物研发、疾病确诊和治疗的进步。

仁科生物目前是SomaLogic在国内的独家合作伙伴,如果您对该技术感兴趣,欢迎与我们取得联系。

上海仁科生物科技有限公司,是一家专业的生命科学及医学领域仪器试剂代理销售和研发生产的公司,代理众多国外知名品牌。提供医疗,生命科学,工业等领域的专业分析产品;为高校、医疗、科研机构以及制药企业提供科学的实验解决方案和技术服务。
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