单细胞全外显子测序,更经济,更高效!(文末有惊喜)
高质量单细胞基因组数据获取
全外显子靶向捕获
数据结果展示
单细胞全外显子Coverage
基于单个细胞全外显子数据,对SNV进行calling, 在30M reads的测序数据量下,单细胞水平的灵敏度可达95%以上,精确度可达99%以上(一个异常细胞除外)。
单细胞全外显子SNV calling
另外,基于在单细胞和100pg bulk的全外显子数据,对其等位基因平衡进行分析,由下图可知单细胞全外显子获得的alleic balance数据与bulk水平类似。
单细胞全外显子Allelic balance
总之,高质量单细胞基因组数据对下游高质量的外显子组富集至关重要。利用Bioskryb Genomics公司提供的原代模版定向扩增技术(PTA)对单个细胞的全基因组进行扩增,以获得高均一性,高覆盖度,高精确度和灵敏度的基因组数据。
基于高质量数据,采用IDT全外显子探针对基因组外显子区域进行靶向捕获,大大降低单个细胞的全基因测序费用和周期,以获得更加精细的单细胞基因组水平上的致病突变位点。
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