单细胞全外显子测序,更经济,更高效!(文末有惊喜)

在这个单细胞多组学爆火的时代,单细胞基因组测序由于其保真性的受限,发展相对来说滞后一点,但是,现在我们欣喜的告诉您,Bioskryb不仅可以做单细胞全基因组测序(单细胞全基因组+全转录组解决方案出炉啦!),Bioskryb联合IDT还可以做单细胞全外显子测序啦!单细胞全外显子测序,精准靶向外显子区域,深入研究细胞的异质性,大大降低测序成本,让您的研究更经济,更高效!接下来,让小编为您详细的介绍一下我们的单细胞全外显子检测方案吧!
我们的单细胞全外显子测序方案是利用BioskrybGenomics公司PTA(Primary Template-directed Amplication, 原代模版定向扩增)技术获得高质量的单细胞全基因组文库,而后采用国际进口IDT 全外显子探针及配套试剂进行捕获,以获得高质量的单细胞全外显子数据。此外在以后您经费允许或者科研需要的情况下还是可以继续把最初单细胞WES捕获之前的WGS文库拿出来进行单细胞全基因组测序

 

 

高质量单细胞基因组数据获取

BioSkryb Genomics提供创新的基于PTA技术的单细胞全基因组扩增产品及NGS完整解决方案,引领单细胞基因组学研究和转化应用的变革。可实现95%以上的单细胞全基因组覆盖率以及优于其他传统WGA技术的高保真性和均一性。

Bioskryb Genomics PTA技术原理及优势
具体操作流程如下,对分离得到的单细胞进行裂解和全基因组扩增,之后对扩增产物进行文库构建,流程如下:

单细胞全基因组操作流程

 

全外显子靶向捕获

利用IDT xGen Exome Research Panel v2全新的全外显子解决方案,提供对人类外显子组的深度均匀覆盖。xGen Exome Research Panel v2覆盖34Mb的人类基因组,包括415,115条单独合成的探针,这些探针均按照ISO13485标准制造并单独进行质量控制评估。通过规模化进行xGen Exome Research Panel v2中各个探针的单独合成和质量控制,最大限度减少了各批差异,从而提供一致的的结果和减少进一步测序和下游验证的需求。
基于获得的高覆盖度高均一性的单细胞基因组数据,利用IDT xGen Exome Research Panel v2探针及配套试剂进行靶向捕获,以获得单细胞全外显子数据,流程如下:

 

数据结果展示

本研究是利用PTA技术对11个HG001单细胞和100pg基因组DNA分别进行PTA扩增和建库,而后均采用xGenTM Exome Panel v2进行单细胞全外显子靶向捕获和测序。
如下图可得到,单细胞全外显子数据中87%的碱基可获得20x的测序覆盖。

单细胞全外显子Coverage

基于单个细胞全外显子数据,对SNV进行calling, 在30M reads的测序数据量下,单细胞水平的灵敏度可达95%以上,精确度可达99%以上(一个异常细胞除外)。

 

 

单细胞全外显子SNV calling

另外,基于在单细胞和100pg bulk的全外显子数据,对其等位基因平衡进行分析,由下图可知单细胞全外显子获得的alleic balance数据与bulk水平类似。

 

 

单细胞全外显子Allelic balance

总之,高质量单细胞基因组数据对下游高质量的外显子组富集至关重要。利用Bioskryb Genomics公司提供的原代模版定向扩增技术(PTA)对单个细胞的全基因组进行扩增,以获得高均一性,高覆盖度,高精确度和灵敏度的基因组数据。

基于高质量数据,采用IDT全外显子探针对基因组外显子区域进行靶向捕获,大大降低单个细胞的全基因测序费用和周期,以获得更加精细的单细胞基因组水平上的致病突变位点。

 

文末惊喜,劲爆促销!

即日起,如果您想尝试单细胞全基因组测序/单细胞全外显子测序或者单细胞全基因组+全长转录组测序,请抓紧扫描下方二维码注册,抢占名额,我们将对注册的前十位给予Bioskryb Resolve DNA试剂盒或Bioskryb Resolve OME试剂盒六折的优惠!(如果注册前十位有客户放弃购买,优惠名额则顺延。)其余注册用户,也将享受八折优惠!

 

本次促销活动截止时间是2024年6月30日,此优惠权益必须在2024年6月30日之前完成下单,过期失效。
本次活动的最终解释权归仁科生物所有,如果您有任何问题,欢迎与我们取得联系

 

 
上海仁科生物科技有限公司,是一家专业的生命科学及医学领域仪器试剂代理销售和研发生产的公司,代理众多国外知名品牌。提供医疗,生命科学,工业等领域的专业分析产品;为高校、医疗、科研机构以及制药企业提供科学的实验解决方案和技术服务。
上海市徐汇区龙漕路299号3A幢7层    Tel:021-34250079  Web:www.bio-star.cn  Email:marketing@bio-star.cn
广州办事处:广州市越秀区中山三路33号B塔3708B
武汉办事处:武汉市洪山区珞喻路10号群光中心二馆1107室
成都办事处:成都市青羊区西御街3号领地中心东塔14-135
北京办事处:北京市西城区宣武门外大街9号1号楼8302
香港办事处:Unit 1003, 10/F, The Rainbow, 22 Wang Yip Street South, Yuen Long, HK(元朗宏業南街22號虹方10樓1003室)
 
 

 

浏览量:0